Среди всех механизмов деградации белков в клетке можно отдельно выделить убиквитин-протеасомную систему, принцип работы которой основан на избирательном мечении белков лигазным комплексом с помощью убиквитинилирования.
Такая метка облегчает распознавание протеасомой — белковой машиной, способной деградировать белки, связанные с цепочкой из нескольких убиквитинов.
Благодаря UPS можно распознавать изменения в структуре белков, вызванные мутацией, сбоем или успешным завершением функционального цикла, и расщеплять такие «нежелательные» белки.
Концепция PROTAC (PROTeolysis TArgeting Chimera) основана на принципе создания индуцированной близости лигазного комплекса и POI таким образом, чтобы между ними возникали белок-белковые взаимодействия, опосредующие акты убиквитинилирования и последующей протеасомной деградации.